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PDB-Metrics: a web tool for exploring the PDB contents. Autoria: FILETO, R.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; RIBEIRO, A. A.; QUINALIA, T. G.; FRANCO, E. H.; MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; OLIVEIRA, S. R. M.; SANTOS, E. H.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; CRUZ, S. A. B.; NESHICH, G. Abstract. PDB-Metrics (http://sms.cbi.cnptia.embrapa.br/SMS/pdb_metrics/index.html) is a component of the Diamond STING suite of programs for the analysis of protein sequence, structure and function.... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2006
Variability of ricin content in mature seeds of castor bean. Autoria: BALDONI, A. B.; CARVALHO, M. H. DE.; SOUSA, N. L.; NOBREGA, M. B. de M.; MILANI, M.; ARAGÃO, F. J. L. The objective of this work was to evaluate ricin concentration in castor bean seeds (Ricinus communis) of 20 accessions from the Banco de Germoplasma de Mamoneira of the Embrapa Algodão, Campina Grand... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2011
Beef quality from animals raised in three different grazing systems. Autoria: CARVALHO, S. C. S.; FRANCISCO, V. C.; FURTADO, A. J.; CHAMILETE, S. A. M.; SILVA, K. F.; RODRIGUES, P. H. M.; NASSU, R. T. The increase in greenhouse gas emissions (GHG) is considered one of the leading causes of global warming, and enteric methane (CH4) from beef cattle represents an important emission source in the agri... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2024
The Diamond Sting server. Autoria: NESHICH, G.; BORRO, L. C.; HIGA, R. H.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; FRANCO, E. H.; KRAUCHENCO, J. N.; FILETO, R.; RIBEIRO, A. A.; BEZERRA, G. B. P.; VELLUDO, T. M.; JIMENEZ, T. S.; FURUKAWA, N.; TESHIMA, H.; KITAJIMA, K.; BAVA, A.; SARAI, A.; TOGAWA, R. C.; MANCINI, A. L. Diamond STING is a new version of the STING suite of programs for a comprehensive analysis of a relationship between protein sequence, structure, function and stability. We have added a number of new... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2005
Structural analyses of CRY 1Ac protein from Bacillus thuringiensis. Autoria: JESUS, K. R. E. de; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. Cry protein is a delta endotoxin of the Bacillus family that provides an entomopatogenic activity to Bacilius thuringiensis. These proteins have a specific toxic activity against three types of insect... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2005
Electrostatic potential calculation for biomolecules - creating a database of pré-calculated values reported on a per residue basis for all PDB protein structures. Autoria: ROCCHIA, W.; NESHICH, G. Abstract. STING and JavaProtein Dossier provide a collection of physical-chemical parameters, describing protein structure, stability, function, and interaction, considered one of the most comprehensi... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2007
Cálculo analítico de parâmetros estruturais de proteínas usando a teoria Alpha Shapes. Autoria: BEZERRA, G. B. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; VIEIRA, F. D.; SANTOS, E. H. dos; NARCISO, M. G.; FALCAO, P. R. K. O modelo matemático da estrutura protéica é fundamental não só para a visualização, mas, principalmente, para o cálculo de parâmetros estruturais como área da superfície e volume. É possível usar a ge... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2007
The Diamond STING Server. Autoria: NESHIC, G.; BORRO, L. C.; HIGA, R. H.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E.; FRANCO, E. H.; KRAUCHENCO, J. N.; FILETO, R.; RIBEIRO, A. A.; BEZERRA, G. B.; VELLUDO, T. M.; JIMENEZ, T. S.; FURUKAWA, N.; TESHIMA, H.; KITAJIMA, K.; BAVA, A.; SARAI, A. TOGAWA, R. C.; MANCINI, A. L. Diamond STING is a new version of the STING suite of programs for a comprehensive analysis of a relationship between protein sequence, structure, function and stability. We have added a number of new... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2005
Nuclear DNA content and chromosome number in Brachiaria spp. genotypes. Autoria: TIMBÓ, A. L. DE O.; PEREIRA, R. C.; SOUZA SOBRINHO, F. de; DAVIDE, L. C. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2014
Protein cutoff scanning: a comparative analysis of cutoff dependent and cutoff free methods for prospecting contacts in proteins. Autoria: SILVEIRA, C. H. da; PIRES, D. E. V.; MINARDI, R.; RIBEIRO, C.; VELOSO, C. J. M.; LOPES, J. C. D.; MEIRA JÚNIOR, W.; NESHICH, G.; RAMOS, C. H. I.; HABESCH, R.; SANTORO, M. M. In this study, we carried out a comparative analysis between two classical methodologies to prospect residue contacts in proteins: the traditional cutoff dependent (CD) approach and cutoff free Delaun... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2009

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