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Contacts as the key elements for comparing two protein structures. Autoria: MELO, R. C.; MAZONI, I.; NESHICH, G.; SANTORO, M. M.; MEIRA JÚNIOR, W. Short Abstract: TopSiMap (Topological Similarity Map) is and interactive tool which is part of the Star Sting Suite (http://sms.cbi.cnptia.embrapa.br/SMS).As contacts pattern is very conserved in each... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2006
MSSP: simultaneous comparison of the same structure descriptor for different protein structures. Autoria: MAZONI, I.; KUSER, P.; YAMAGISHI, M.; BORRO, L.; JARDINE, J.; SANTOS, E. H. dos; OLIVEIRA, S. R. de M.; NESHICH, G. Short Abstract: The Multiple Structures - Single Parameter STING module allows a user to compare variety of structure parameters from different protein structures in a simple yet intuitive 2D pilot. T... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2006
Electrostatic potential calculation for biomolecules - creating a database of pré-calculated values reported on a per residue basis for all PDB protein structures. Autoria: ROCCHIA, W.; NESHICH, G. Abstract. STING and JavaProtein Dossier provide a collection of physical-chemical parameters, describing protein structure, stability, function, and interaction, considered one of the most comprehensi... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2007
Predicting enzyme class from protein structure using Bayesian classification. Autoria: BORRO, L. C.; OLIVEIRA, S. R. M.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; HIGA, R. H.; KUSER, P. R.; NESHICH, G. ABSTRACT. Predicting enzyme class from protein structure parameters is a challenging problem in protein analysis. We developed a method to predict enzyme class that combines the strengths of statistic... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2006
BlueStar STING platform for analysis of protein structure / function relationship: designing agrochemicals to fit new protein targets for bacterial, fungal and insect control. Autoria: NESHICH, G. Blue Star STING suite of programs for comprehensive analysis of structure, function and stability of proteins and their complexes, has matured over a decade of development. We will present the in sili... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2012
Development of a suite of bioinformatics tools for the analysis and prection of membrane protein structure. Autoria: TOGAWA, R. C. This thesis describes the development of a novel approach for prediction of the three-dimensional structure of transmembrane regions of membrane proteins directly from amino acid sequence and basic tr... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2006
Protein structure topology comparison based on contact maps. Autoria: MELO, R. C.; MAZONI, I.; NESHICH, G.; SANTORO, M. M.; MEIRA JUNIOR, W. Short Abstract: Topologs (Topology Homologous) is a tool which is part of the Star Sting Suite (http://sms.cbi.cnptia.embrapa.br/SMS). It is a structural classification of proteins totally based on th... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2006
The Cry 1Ac protein from Bacillus thuringiensis and its structure stability centers. Autoria: JESUS, K. R. E. de; KUSER, P.; NESHICH, G. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2006
Protein ligand contacts analyzed in an integrated environment with the other sequence and structure related parameters. Autoria: FALCÃO, P. R. K.; MAZONI, I.; YAMAGISHI, M. E. B.; BORRO, L. C.; JARDINE, J. G.; SANTOS, E. H. dos; OLIVEIRA, S. R. de M.; NESHICH, G. Short Abstract: The Protein Ligand Contacts ? the new STING module allows a user to compare the contacts established between the ligand and the protein together with the variety of other structure par... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2006
Genetic structure and diversity of a soybean germplasm considering biological nitrogen fixation and protein content. Autoria: TORRES, A. R.; GRUNVALD, A. K.; MARTINS, T. B.; SANTOS, M. A. dos; LEMOS, N. G.; SILVA, L. A. S.; HUNGRIA, M. Biological nitrogen fixation (BNF) has global economic and environmental importance, but has often not been considered in soybean [Glycine max (L.) Merrill] breeding programs. Knowing the genetic dive... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2015

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