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A web-based platform for RNA-Seq data analysis and storage: a case study on soybean gene expression experiments. Autoria: BINNECK, E.; NASCIMENTO, L. S. do The availability of the soybean genome sequence and the rapid evolution of DNA sequencing technologies in recent years bring us exciting new promises for scientific discovery and its conversion into r... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2012
Assessing new tools and best practices for RNA seq data analysis and visualization with iPlant cyberinfrastructure. Autoria: CHOUGULE, K, M.; OLSON, A.; MAGALHAES, J. V. de; VAN BUREN, P.; WANG, L.; WARE, D. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2015
Transcriptome analysis in Coffea eugenioides, an Arabica coffee ancestor, reveals differentially expressed genes in leaves and fruits. Autoria: YUYAMA, P. M.; REIS JUNIOR, O.; IVAMOTO, S. T.; DOMINGUES, D. S.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; CHARMETANT, P.; LEROY, T.; PEREIRA, L. F. P. Studies in diploid parental species of polyploid plants are important to understand their contributions to the formation of plant and species evolution. Coffea eugenioides is a diploid species that is... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2016
Identificação e caracterização de variantes funcionais no transcriptoma de duodeno em poedeiras. Autoria: IBELLI, A. M. G.; SALMÓRIA, L. A.; TAVERNARI, F. de C.; PEIXOTO, J. de O.; MARCELINO, D. E. P.; DAL PIZZOL, M. S.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Resumo: O aumento no número de trabalhos de sequenciamento de RNA (RNA-Seq) tem permitido que estes dados sejam utilizados em abordagens além da análise de expressão gênica diferencial. Entre elas, po... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2022
Gene co-expression networks associated with carcass traits reveal new pathways for muscle and fat deposition in Nelore cattle. Autoria: VIGNATO B. S.; COUTINHO, L. L.; POLETI, M. D.; CESAR, A. S. M.; MONCAU, C. T.; REGITANO, L. C. de A.; BALIEIRO, J. C. C. Positively correlated with carcass weight and animal growth, the ribeye area (REA) and the backfat thickness (BFT) are economic important carcass traits, which impact directly on producer's payment. T... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2019
RNA-Seq Analysis of Eucalyptus Genotypes that Differ in Carbon Allocation. Autoria: GERHARDT, I. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; LOBO, F. P.; PENCHEL, R. M.; MISSIAGGIA, A. A.; ZERTOLINI, A.; SILVA, F. R. da Repositório: BDPA Ano de publicação: 2012
Análise de genes diferencialmente expressos em Herbaspirillum seropedicae, estirpe HRC54, cultivado na presença do líquido apoplástico de cana-de-açúcar. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2016
Differentially expressed genes in Longissimus dorsi muscle of Nelore steers divergent for average daily gain. Autoria: SILVA, J. V. da; TIZIOTO, P. C.; NEUBERN, P. S. N. de; AFONSO, J.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; SOUZA, M. M. de; ROCHA, M. I. P.; BUSS, C. E.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2016
Genes diferencialmente expressos no músculo Longissimus dorsi de novilhos nelore divergentes para eficiência bruta. Autoria: SILVA, J. V. da; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; AFONSO, J.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; SOUZA, M. M. de; ROCHA, M. I. P.; BUSS, C. E.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2016
Transcriptoma de frutos de Coffea arabica L. ao longo do seu desenvolvimento inicial. Autoria: IVAMOTO, S. T.; REIS JUNIOR, O.; CARAZZOLLE, M. F.; DOMINGUES, D. S.; PEREIRA, L. F. P. Neste trabalho foi realizado o seqüenciamento de RNA em larga escala de 12 bibliotecas de Coffea arabica cv. IAPAR59: folha, flor, frutos ao longo do seu desenvolvimento e frutos tratados com o induto... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2013

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