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Comparing methods of RNAseq analysis for species without a reference genome. Author(s): PADILHA, L.; CAIXETA, E. T.; SILVA, F. R. da New sequencing technologies brought deep probing of transcriptomes (so-called RNAseq) to the reach of individual researches. Analysis of RNAseq sequences, however, depend on the alignment of reads to... ... Repository: BDPA Publication year: 2012
Counting RNAseq reads: which way is better? Author(s): SILVA, F. R. da; NODA, R. W.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; CARNEIRO, N. P. In this work we show the variation of results we?ve found while working with ~1 billion Illumina reads from drought tolerant Sorghum bicolor genotype in the presence and absence of the stress and comp... ... Repository: BDPA Publication year: 2013
Utilização da plataforma Galaxy na análise de dados de RNAseq. Author(s): NAGAI, L. A. E.; GIACHETTO, P. F.; ZERLOTINI NETO, A. Este trabalho teve como objetivo avaliar a plataforma Galaxy na análise de dados de RNA-seq, uma metodologia de sequenciamento de transcritos (moléculas de RNAm) que utiliza as novas tecnologias de se... ... Repository: BDPA Publication year: 2012
Análise de RNASeq de genes responsivos ao déficit hídrico na fase reprodutiva da soja. Author(s): MACEDO, C. R.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARCOLINO-GOMES, J.; MOLINARI, M. D. C.; BARBOSA, D. de A.; ROSA, J. da; MARIN, S. R. R.; MERTZ-HENNING, L. M.; RECH FILHO, E. L.; NEPOMUCENO, A. L. Repository: BDPA Publication year: 2019
Correlação entre a porcentagem de alinhamentos únicos em bibliotecas de RNAseq de soja sob deficit hídrico com diferentes tamanhos de fragmento. Author(s): FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MOLINARI, M. D. C.; BARBOSA, D. A.; CARANHATO, A. L. H.; MARIN, S. R. R.; MERTZ-HENNING, L. M.; NEPOMUCENO, A. L. Repository: BDPA Publication year: 2018
Identificação por RNAseq e validação por qPCR de genes diferencialmente expressos em sorgo em resposta ao estresse hídrico. Author(s): BARROS, B. de A.; CARNEIRO, A. A.; ALVES, P. A.; MOREIRA, R. O.; ALVES, M. de C.; NODA, R. W.; CARNEIRO, N. P. Repository: BDPA Publication year: 2016
Expressão alelo específica em Coffea canephora associados à resistência a nematoides. Author(s): VALERIANO, J. C.; LIMA, E. A. de; AQUINO, S. O. de; CARNEIRO, F. de A.; CARNEIRO, W. W. de J.; MATTOS, N. G.; CARNEIRO, R. M. D. G.; ANDRADE, A. C. Repository: BDPA Publication year: 2019
Development of single nucleotide polymorphism (SNP) markers for genetic map saturation of Urochloa humidicola. Author(s): MORAES, A. da C. L.; VIGNA, B. B. Z.; OLIVEIRA, F. A. de; SILVA, C. B. C.; VALLE, C. B. do; SOUZA, A. P. de Large areas of Brazil are destined for the cultivation of pasture, where the purpose is to feed cattle. Repository: BDPA Publication year: 2017
Transcriptome profiling of Paspalum notatum reveals candidate genes associated to polyploidy and/or apomixis. Author(s): OLIVEIRA, F. A. de; VIGNA, B. B. Z.; FAVERO, A. P.; MATTA, F. de P.; SOUZA, A. P. de Apomixis is an asexual reproduction mode described in more than 400 angiosperm species, which plants are able to produce offsprings that are exact genetic replices of the female parent. Repository: BDPA Publication year: 2017
Caracterização molecular e seleção de genes candidatos à resistência do clone 14 de Coffea canephora CONILON A Meloidogyne paranaensis. Author(s): LIMA, E. A. de; CARNEIRO, F. de A.; RÊGO, E. C. S.; COSTA, T. S.; COTTA, M. G.; JORGE JÚNIOR, A.; MARRACCINI, P.; CARNEIRO, R. M. D. G.; ANDRADE, A. C. Os nematoides das galhas estão entre os patógenos mais nocivos para a agricultura cafeeira no Brasil e C. canephora tem se mostrado fonte de resistência a esses patógenos. Com o objetivo de identifica... ... Repository: BDPA Publication year: 2015

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