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Seleção e introgressão da resistência ao mosaico-comum em milho via retrocruzamento assistido por marcadores moleculares. Author(s): SOUZA, I. R. P. de; PINTO, M. de O.; PAULA, A. L. S. P. de; GUIMARAES, P. E. de O.; GUIMARAES, L. J. M.; TRINDADE, R. dos S. O mosaico-comum do milho, causado pela espécie de potyvirus Sugarcane mosaic virus (SCMV), destaca-se entre as viroses mais importantes na cultura do milho. O vetor mais eficiente na transmissão dessa... ... Repository: BDPA Publication year: 2018
Acurácia de imputação de genótipos para estudos de associação genômica em bovinos da raça Canchim. Author(s): SANTIAGO, G. G.; SIQUEIRA, F.; BOISON, S. A.; CARDOSO, F. F.; REGITANO, L. C. de A.; TORRES JUNIOR, R. A. de A. Repository: BDPA Publication year: 2014
Complex pattern of CAST allelic expression in bovine muscle tissue. Author(s): SOUZA, M. M.; ZERLOTINI, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A. L.; MOKRY, F. B.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. A. Repository: BDPA Publication year: 2014
SNPs and INDELs in genes involved in lipid metabolism of mammary gland of Zebu breeds identified by whole genome sequencing. Author(s): OLIVEIRA, G.; ROSSE, I.; ASSIS, J.; OLIVEIRA, F.; LEITE, L.; ARAÚJO, F.; SALIM, A.; ZERLOTINI, A.; LOPES, B.; ARBEX, W.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G.; VERNEQUE, R.; MARTINS, M.; COIMBRA, R.; SILVA, M. V.; CARVALHO, M. R. In this context, the objective of this study was to sequence and to map the genome of three Guzerá bulls and three Gir bulls in order to identify zebu-specific variations involved in the lipid metabol... ... Repository: BDPA Publication year: 2015
An efficient implementation of Relief-F algorithm for Genome-Wide Association Studies. Author(s): SHIBATA, R.; HIGA, R. Although Relief can be adapted for regression context, in this work we approach only for classification context. Repository: BDPA Publication year: 2012
Construção de um pipeline para identificação e análise de CNVs utilizando dados de chips de genotipagem de SNPs. Author(s): PEREIRA, F. C. de P.; GIACHETTO, P. F. O objetivo desse estudo foi construir um pipeline de bioinformática para a identificação e análise de CNVs a partir dos dados gerados pelos chips de genotipagem de SNPs da plataforma Illumina, o qual... ... Repository: BDPA Publication year: 2012
Initial analysis of copy number variations in canchim beef cattle with extreme phenotypes for ribeye area. Author(s): GIACHETTO, P. F.; PEREIRA, F. C. P.; MOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. A.; SILVA, M. V.; NICIURA, S. C. M.; CARDOSO, F. F.; ALENCAR, M. M.; MEIRELLES, S. L. C.; LIMA, A. O.; REGITANO, L. C. A. Genomic structural variation, in the form of large-scale insertions and deletions, as well as inversions and translocations, are referred to as copy number variations (CNVs). Compared to single nucleo... ... Repository: BDPA Publication year: 2013
An R script for quality control in genome-wide association studies. Author(s): HIGA, R.; BARRICHELLO, F.; NICIURA, S.; MEIRELLES, S.; REGITANO, L. Recent advances in massive genotyping technology based on SNP (Single Nucleotide Polymorphisms) markers are pushing animal breeding research into a new era where the entire genome is screened in the s... ... Repository: BDPA Publication year: 2011
Genomic variant hotspots in nelore cattle revealed by missing genotypes. Author(s): GIACHETTO, P. F.; SILVA, J. M. da; SILVA, L. O. C. da; CINTRA, L. C.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. In order to investigate whether or not the ?missing? genotypes actually reveal genomic variant hotspots, we examined BovineHD missing genotypes from a total of 1,709 Nelore DNA samples and used sequen... ... Repository: BDPA Publication year: 2015
Identificação de CNVs em bovinos Canchim, a partir de dados de genotipagem de SNPs com chips de alta densidade. Author(s): GONÇALVES, A. R.; GIACHETTO, P. F. O objetivo desse estudo foi utilizar uma ferramenta open source, o CNstream (ALONSO et al., 2010), para a identificação de CNVs a partir de dados de genotipagem de bovinos por meio de chips de SNPs da... ... Repository: BDPA Publication year: 2012

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