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Large scale protein function prediction tools. Autoria: MINARDI, R. C. de M.; ARTIGUENAVE, F.; NESHICH, G. In this project we intend to reinforce a recent collaboration established between two French and Brazilian bioinformatics laboratories for the development of a structural genomics approach to function... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2009
Embrapa Bioinformatics Multi-Users Laboratory - LMB. Autoria: KUSER-FALCÃO, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; SILVA, F. R.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; HIGA, R.; VIEIRA, F. The Bioinformatics Multi-Users Laboratory of Embrapa provides an array of shared research resources and infra-structure to the Embrapa community and research collaborators The primary mission of the L... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2012
Binding affinity prediction using a nonparametric regression model based on physicochemical and structural descriptors of the nano-environment for protein-ligand interactions. Autoria: BORRO, L.; YANO, I. H.; MAZONI, I.; NESHICH, G. We propose a new empirical scoring function for binding affinity prediction modeled based on physicochemical and structural descriptors that characterize the nano-environment that encompass both ligan... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2016
RNA-seq analysis of Eucalyptus genotypes that differ in carbon allocation. Autoria: GERHARDT, I. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; LOBO, F. P.; PENCHEL, R. M.; MISSIAGGIA, A. A.; ZERLOTINI, A.; SILVA, F. R. da Carbon allocation is the process of translocation of photosynthate from source to sink organs, and though its physiology is well known, the genetic mechanisms involved in its regulation are still poor... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2012
Development of a suite of bioinformatics tools for the analysis and prection of membrane protein structure. Autoria: TOGAWA, R. C. This thesis describes the development of a novel approach for prediction of the three-dimensional structure of transmembrane regions of membrane proteins directly from amino acid sequence and basic tr... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2006
CNVRanger: association analysis of CNVs with geneexpression and quantitative phenotypes. Autoria: SILVA, V. da; RAMOS, M.; GROENEN, M.; CROOIJMANS, R.; JOHANSSON, A.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L.; ZIMMER, R.; WALDRON, L.; GEISTLINGER, L. Copy number variation (CNV) is a major type of structural genomic variation that is increasingly studied acrossdifferent species for association with diseases and production traits. Established protoc... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2020
Unique crystal structure of a novel surfactant protein from the foam nest of the frog Leptodactylus vastus. Autoria: HISSA, D. C.; BEZERRA, G. A.; BIRNER-GRUENBERGER, R.; SILVA, L. P.; USÓN, I.; GRUBER, K.; MELO, V. M. M. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2014
The Impacts of Compulsory Crop Insurance in the Brazilian Dairy Sector. Autoria: CARVALHO, G. R.; COSTA, R. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2015
Common copy number variation regions affecting dairy traits in Gyr cattle. Autoria: OLIVEIRA JUNIOR, G. A.; CARMO, A. S.; UTSUNOMIYA, A. T. H.; CHUD, T. C. S.; REY, F. S. B.; FERRAZ, J. B. S.; SILVA, M. V. G. B. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2015
Java Merging Copy Number Variants (JM-CNV): a new algorithm for identifying Copy Number Variant Regions (CNVR). Autoria: SILVA, J. M. da; ROMANIUC, A. R.; CAETANO, A. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B. CNVs (Copy Number Variations) are defined as copy number variations of DNA fragments typically larger than one kilobase (Kb), but less than five megabases (Mb). They represent a genomic disequilibrium... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2015

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