Ao longo dos últimos 49 anos, a fruticultura brasileira se expandiu por todo o país, que se tornou o terceiro maior produtor mundial de frutas. Surgiram dezenas de polos de produção frutícola, até mesmo no semiárido nordestino, que vem se sobressaindo pela exportação de frutas frescas de excelente qualidade. A contribuição da Embrapa Mandioca e Fruticultura foi e tem sido muito importante nesse contexto. Entre outras tecnologias, variedades de citros e de banana geradas, adaptadas e recomendadas pela Unidade têm desempenhado papel de destaque. Inovações e ajustes tecnológicos estimularam a produção de abacaxi no Brasil, que passou a ser o maior produtor mundial há alguns anos, com benefícios especiais para as empresas familiares, principais responsáveis pelo cultivo. A equipe técnica da Unidade participou da evolução da cultura do abacaxi em muitas regiões produtoras, a exemplo de Itaberaba (BA) — nos últimos 20 anos, a fruta se tornou o principal produto agrícola do município — e do Tocantins, hoje considerado o estado produtor do melhor abacaxi do país em qualidade e produtividade. O trabalho com mamão também evoluiu significativamente. Embora o Brasil tenha perdido a condição de maior produtor mundial para a Índia, o mamão hoje é uma cultura bem estabelecida principalmente na região do Extremo Sul da Bahia e Norte do Espírito Santo.

A cadeia produtiva de mandioca, alimento básico de grande parte da população brasileira, tem passado por grandes transformações. Em muitas regiões, passou de tradicional cultura de subsistência para o status de cultura do pequeno ao grande agronegócio, com a oferta de extensa gama de produtos derivados e de significativo valor agregado. A farinha ainda é fundamental, mas a fécula da mandioca passou a ser o produto âncora de muitos empreendimentos, sobretudo no Centro-Sul. Para atender a essa demanda, a Unidade já lançou duas variedades de mandioca para a indústria, com alto rendimento de amido, a BRS CS01 e a BRS 420. Dezenas de novas variedades, com resistência a doenças e pragas, adaptadas a diferentes condições ambientais, têm sido geradas e recomendadas, sobretudo para ecossistemas do Nordeste e Norte do país, como a BRS Novo Horizonte e a BRS Poti Branca, também para produção de fécula. Levantamentos recentes mostram relevante índice de adoção das cultivares BRS Kiriris, nos tabuleiros costeiros, e BRS Formosa, no sudoeste da Bahia, região com incidência da bacteriose. Alianças estratégicas da pesquisa com a iniciativa privada e organizações de produtores têm contribuído para o aprimoramento da cadeia produtiva de mandioca em várias regiões.