Em 2015, a Embrapa Milho e Sorgo obteve a Licença Ambiental de Operação em Caráter Corretivo (LOC) junto à Superintendência Regional de Meio Ambiental – Central Metropolitana (Supram-CM), vinculada à Secretaria de Estado de Meio Ambiente e Desenvolvimento Sustentável (Semad/MG). Em 2021, a Embrapa submeteu o pedido de renovação e obteve a Licença Ambiental Simplificada junto à Semad estando, portanto, em operação regular no que se refere à operação de suas atividades potencialmente poluidoras ou degradadoras previstas na Deliberação Normativa COPAM nº 217 de 2017, a saber: Ponto de abastecimento; Culturas anuais; Canais de irrigação.

Também em 2015, de forma concomitante à Licença Ambiental, a Embrapa obteve a regularização de todas suas captações de água, que são fundamentais para dar segurança hídrica aos experimentos de campo e em casa de vegetação dos projetos de pesquisa, pelo manejo da irrigação. Essas outorgas estão em fase de renovação, já tendo obtido o certificado e publicação de portarias de sete dos dez processos. Além do uso responsável dos recursos hídricos, a Embrapa tem envidado todos os esforços necessários para cumprir as condicionantes de outorga, como registros de consumo e adequações de estruturas necessárias para o funcionamento das captações.