Os avanços na área de biotecnologia indicam que é possível controlar algumas pragas em diversas culturas de interesse agrícola com um mínimo de impacto no meio ambiente. O Bacillus thuringiensis deposita, no citoplasma da célula em esporulação, inclusões cristalinas de natureza protéica e com atividade para larvas de insetos de diversas ordens. Os genes cry, que codificam as delta-endotoxinas contidas no cristal, podem ser clonados, transferidos e expressos em altos níveis em plantas e bactérias. Esses genes normalmente estão localizados em plasmídeos e um destes foi inteiramente sequenciado.
Na maioria dos casos, o sequenciamento restringe-se a fragmentos, contendo os genes de delta-endotoxinas e fragmentos adjacentes. No Brasil, a estirpe S76 de B. thuringiensis já mostrou uma alta atividade entomopatogênica contra o inseto Diatraea saccharalis, que ataca a lavoura canavieira. Após o sequenciamento do genoma dessa estirpe - finalizado pela Embrapa Agrobiologia em parceria com a instituição FASTERIS SA, da Suíça - havia a necessidade de realizar a anotação das sequências, com o objetivo de caracterizar os diferentes genes dentro do seu contexto genômico, que inclui a informação de operons e sequências regulatórias.
Este projeto teve por objetivo identificar a maior parte dos genes sequenciados e também isolar e clonar pelo menos três genes cry de interesse agrícola relacionados diretamente com atividade entomopatogênica contra a D. saccharalis e a S. fugiperda. A expressão heteróloga desses genes na bactéria E. coli e bioensaios com as proteínas produzidas permitiram avaliar o potencial da bactéria Bt, estirpe S76, no controle das duas principais pragas que atacam as culturas de cana-de-açúcar e milho plantadas no Estado do Rio de Janeiro e em todo o Brasil.