LBB - Laboratório de Bioinformática 

Linhas de Pesquisa

Bioinformática genômica (montagem, anotação e comparação de genomas e transcriptomas; análise de repetições e elementos transponíveis; análises filogenéticas; análise de variantes e marcadores moleculares; descoberta e caracterização de genes, promotores e reguladores); desenvolvimento de sistemas e processamento de dados para bioinformática (pipelines de análise; sistemas web; manipulação de dados biológicos massivos por meio de programação computacional).

Estrutura e equipamentos

O laboratório conta com 50 m2 em dois ambientes separados. Na sala de apoio, para usuários avançados, estão 6 desktops, e no laboratório principal (37 m2), para bioinformatas e desenvolvedores, estão atualmente 5 estações de trabalho móveis de alto desempenho, com 2 monitores (HP EliteBook Folio 1040 G1) e mais 1 desktop de parceiro. Todos com acesso aos servidores do LBB, organizados em rack próprio no CPD da Unidade. No rack, estão instalados 5 servidores, sendo 3 (HP ProLiant DL785 G5, HP ProLiant DL585 G7 e Dell PowerEdge R930) utilizados diretamente em análises de bioinformática e 2 (HP ProLiant DL380 G5 e HP ProLiant DL380 G7) utilizados como base para diferentes máquinas virtuais (PostgreSQL, MySQL, Bacula, servidor web, Zabbix, servidor de arquivos, proxy reverso, GitLab). Ainda no rack, 2 storages (HP StorageWorks MSA60 e HP P2000 G3 MSA Array System), sistema de backup em fitas (IBM System Storage TS 3100 Tape Backup LTO-3) e KVM para conexão local com os equipamentos.