Considerando a crescente demanda por ferramentas e métodos quantitativos capazes de extrair de dados genômicos informações relevantes para o melhoramento genético e para decisões de manejo em animais domésticos, o presente projeto propôs desenvolver ferramentas e métodos quantitativos para análise de dados genômicos obtidos pela nova geração de tecnologias de sequenciamento e genotipagem em larga escala. A pesquisa gerou um conjunto de conhecimentos, metodologias e ferramentas estatísticas e resultou na formação de uma equipe mais ampla de técnicos capacitados para viabilizar a prospecção de genes de interesse econômico e o uso da informação genômica nos rebanhos bovinos, suínos, caprinos, ovinos e de aves do Brasil. Além disso, esses resultados servem de referência para estudos com outras espécies animais e vegetais de importância para a pesquisa na Embrapa e no Brasil. O Projeto envolveu a participação da Embrapa por meio de suas Unidades Pecuária Sul, Informática Agropecuária, Recursos Genéticos, Pecuária Sudeste, Gado de Leite, Gado de Corte, Suínos e Aves, Caprinos e ovinos, além da participação Universidade Estadual Paulista - Campus Jaboticabal, Gensys Consultores Associados, Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo, Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Instituto Nacional de Investigacion Agropecuaria - Estacion Experimental Las Brujas-URU, Universidade Estadual de Campinas, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Michigan State University – USA, Universidade Federal de São Carlos, Universidade Federal de Pelotas e Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES).