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Author(s): VIEIRA, F. D.; OLIVEIRA, S. R. de M.

Este artigo apresenta um conjunto de modelos baseados em técnicas de mineração de dados para selecionar os principais marcadores SNP (Single Nucleotide Polymorphism) para as raças de ovinos Crioula, M... ...

Repository: BDPA     Publication year: 2015

Author(s): SILVA, M. V. G. B.; OLIVEIRA JUNIOR, G.; REY, F. S. B.; GIACHETTO, P. F.; MACHADO, M. A.; VERNEQUE, R. da S.; FERRAZ, J. B. S.

The aim of this work was to investigate, based on a high density BovineHD SNP array, the abundance and distributions of CNVs and CNVR in a Gyr cattle population from Brazil. Genotype data of represent... ...

Repository: BDPA     Publication year: 2014

Author(s): HIGA, R. H.; OLIVEIRA, G. B. de

Este documento apresenta o manual do software anotaSNP, que tem por objetivo apoiar pesquisadores na análise de experimentos envolvendo estudos de associação genótipo-fenótipo.

Repository: BDPA     Publication year: 2014

Author(s): LACERDA, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; FACÓ, O.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R.

Repository: BDPA     Publication year: 2014

Author(s): SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B.

Genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping platforms have been widely used in studies in diverse areas, ranging from population genetics to applied genetic improvement and breeding. S... ...

Repository: BDPA     Publication year: 2014

Author(s): GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H.

Este capítulo tem por objetivo colocar o leitor a par do estado da arte das principais aplicações da bioinformática na agricultura, particularmente àquelas relacionadas ao melhoramento genético animal... ...

Repository: BDPA     Publication year: 2014

Author(s): GUERREIRO, A. T.; HIGA, R. H.

O objetivo deste trabalho é a criação de um pacote R (R CORE TEAM, 2014) que implemente quatro diferentes métodos de GSEA no contexto de GWAS, considerando adaptações para aplicação em espécies animai... ...

Repository: BDPA     Publication year: 2014

Author(s): ROSSE, I. C.; ASSIS, J. G.; OLIVEIRA, F. S.; LEITE, L. R.; ARAUJO, F.; ZERLOTINI, A.; LOPES, B. C.; ARBEX, W. A.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. S.; GUIMARÃES, M. F. M.; SILVA, M. V. G. B.; COIMBRA, R. S.; OLIVEIRA, G.; CARVALHO, M. R. S.

In this context, the objective of this work was to sequence and assemble the genome of one Guzerá bull in order to identify breed-specific variations that might be included in the genotyping arrays an... ...

Repository: BDPA     Publication year: 2014

Author(s): MIOTTO, Y. E.; PORTO, D. D.; ALENCAR, S. A. de; DELATORRE, C. A.; REVERS, L. F.

O objetivo deste trabalho foi identificar polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) nos quatro primeiros milhões de pares de base da extremidade do GL9 de macieira, bem como o mapeamento de alta resol... ...

Repository: BDPA     Publication year: 2015

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