A mangabeira, além das pragas já mencionadas, está sujeita à ação de outros organismos menos frequentes e pouco estudados, mas que podem se tornar pragas relevantes e ocasionar prejuízos futuramente com a expansão da área cultivada e da sua monocultura. Como exemplos, podem-se citar a ocorrência de larvas de mosca-das-frutas das famílias Tephritidae (Anastrepha spp. e Ceratitis capitata] e Lonchaeidae (Neosilba sp.) danificando frutos de mangaba em pomar no município de Goiânia – GO, e o registro de perdas na fase de viveiro, ocasionadas pelo consumo de sementes recém plantadas ou em fase de germinação no solo, por ratos, na Região Nordeste.