A Embrapa Agroenergia é uma das 43 Unidades de pesquisa da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) e atua para promover a competitividade da bioeconomia brasileira. O modelo de negócios é focado na geração de ativos pré-tecnológicos e tecnológicos para inserção no mercado de inovação.

Para tanto, adota um modelo de inovação aberta, que permite cooperar com instituições e empresas públicas e privadas para codesenvolver soluções eficientes e sustentáveis de conversão de biomassa e resíduos agroindustriais em biocombustíveis e bioprodutos. O modelo de gestão da Unidade integra Pesquisa, Desenvolvimento e Inovação (PD&I) com Transferência de Tecnologia (TT) e está estruturado em quatro eixos: Biomassas para Fins Industriais, Biotecnologia Industrial, Química de Renováveis e Materiais Renováveis.