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A utilização de técnicas de varredura genômica, como a determinação de regiões de QTLs (quantitative trait loci) e a análise de expressão gênica, pode resultar em centenas e, por vezes, milhares de genes candidatos. Estes genes precisam, então, ser analisados em bancada, o que consome uma grande quantidade de recursos humanos e financeiros. Uma estratégia para lidar com estes conjuntos muito grandes de genes candidatos consiste em minerar os genes mais promissores, ou seja, aqueles com maior cha ...

Situação: concluído     Data de Início: Sat Jan 01 00:00:00 GMT-03:00 2011

Em um esforço conjunto reunindo pesquisadores das áreas de biotecnologia, bioinformática, estatística genômica, fisiologia vegetal e melhoramento genético, esse projeto prevê prospectar genes de tolerância à seca. Será abordada a estratégia de mapeamento de associação baseada em GbS e genes-candidatos, com ênfase na proposição de métodos de seleção genômica utilizando marcadores relacionados à QTLs-alvos.

Dados fenotípicos para os componentes de produtividade e morfofisiológicos serão ...

Situação: concluído     Data de Início: Tue Apr 01 00:00:00 GMT-03:00 2014

O gênero Mimosa, da família Leguminosae, é composto por cerca de 480 espécies, das quais grande parte é encontrada no Brasil. Há desde espécies herbáceas até arbóreas e elas se desenvolvem em áreas alagadas, secas, campos de altitude, cerrado, entre outros ecossistemas. São bem conhecidas e utilizadas na reabilitação de solos degradados por sua agressividade e pela capacidade de desenvolvimento nas mais adversas condições de solo. Isso também é uma consequência da simbiose com ba ...

Situação: concluído     Data de Início: Wed Jul 01 00:00:00 GMT-03:00 2009

Este projeto contempla o desenvolvimento de ferramentas de biotecnologia avançada, visando contribuir para a geração de conhecimento sobre mecanismos de tolerância a estresse hídrico e resistência a patógenos fúngicos de importância crescente, a identificação e caracterização funcional de genes candidatos envolvidos nestes processos, e de marcadores moleculares associados aos caracteres de interesse, para assistir e tornar mais eficiente o melhoramento genético da soja. O foco é o estudo de gene ...

Situação: concluído     Data de Início: Tue Nov 01 00:00:00 GMT-03:00 2011

Considerando a crescente demanda por ferramentas e métodos quantitativos capazes de extrair de dados genômicos informações relevantes para o melhoramento genético e para decisões de manejo em animais domésticos, o presente projeto propôs desenvolver ferramentas e métodos quantitativos para análise de dados genômicos obtidos pela nova geração de tecnologias de sequenciamento e genotipagem em larga escala. A pesquisa gerou um conjunto de conhecimentos, metodologias e ferramentas estatísticas e res ...

Situação: concluído     Data de Início: Tue Jan 01 00:00:00 GMT-03:00 2013

A primeira década do século 21 viu a genômica se consolidar como “sine qua non” para a caracterização de recursos genéticos. Centenas de projetos para decifrar o genoma completo de plantas e microrganismos foram concluídos ou estão em curso. O custo do sequenciamento de DNA tem caído vertiginosamente nos últimos cinco anos e a expectativa é que em 2011 as tecnologias que estarão disponíveis irão permitir sequenciar 100.000 pares de bases por apenas um dólar americano. À medida que o mundo se

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Situação: concluído     Data de Início: Mon Aug 01 00:00:00 GMT-03:00 2011

A identificação de genes de interesse econômico pode significar considerável vantagem competitiva em mercados cada vez mais competitivos e globalizados. Genes associados à resistência a pragas, aumento de produtividade e características organolépticas (que podem ser percebidas pelos sentidos humanos, como cor, sabor e textura) valorizadas pelos consumidores são extremamente importantes para a pecuária brasileira. A prospecção deles demanda ferramentas tanto de biotecnologia quanto de bioinformát ...

Situação: concluído     Data de Início: Tue Jan 01 00:00:00 GMT-03:00 2008

Em várias regiões do país, inclusive no Vale do São Francisco, a presença do nematóide provoca perdas significativas na produção de goiabeiras. Até o momento, não existem métodos de controle efetivos. Produtos químicos, avaliados experimentalmente, não têm sido eficientes no seu controle e não existem nematicidas registrados no Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (MAPA) para utilização nos plantios dessa frutífera. Além disso, a falta de compatibilidade de enxertia de goiabeiras ...

Situação: concluído     Data de Início: Thu Nov 01 00:00:00 GMT-03:00 2012

A formação e o estabelecimento de uma rede para a expressão de biomoléculas em plantas e microrganismos transgênicos deverá formar a base fundamental para a utilização de sequencias regulatórias e codificadoras, prospectadas e caracterizadas, através de diferentes projetos genoma. O projeto apresentado propõe a prospecção, clonagem, sequenciamento de moléculas recombinantes, modificação da estrutura modular de proteínas (engenharia de proteínas), construção de vetores de expressão, análise molec ...

Situação: concluído     Data de Início: Mon Sep 01 00:00:00 GMT-03:00 2008

O advento das novas tecnologias de sequenciamento de DNA viabilizaram a concepção e execução de novos projetos, que se baseiem em abordagens como resequenciamento, sequenciamento de novo, genotipagem por sequenciamento, imputação, metagenômica, etc., mas que demandam armazenamento, tratamento e análise de uma quantidade muito grande de dados. O grande desafio deste projeto, na fase II da Rede Genômica Animal (RGA), é, em parceria com o Laboratório Multiusuário de Bionformática da Embrapa (LMB), ...

Situação: concluído     Data de Início: Tue Jan 01 00:00:00 GMT-03:00 2013