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A utilização de técnicas de varredura genômica, como a determinação de regiões de QTLs (quantitative trait loci) e a análise de expressão gênica, pode resultar em centenas e, por vezes, milhares de genes candidatos. Estes genes precisam, então, ser analisados em bancada, o que consome uma grande quantidade de recursos humanos e financeiros. Uma estratégia para lidar com estes conjuntos muito grandes de genes candidatos consiste em minerar os genes mais promissores, ou seja, aqueles com maior cha ...

Situação: concluído     Data de Início: Sat Jan 01 00:00:00 GMT-03:00 2011

O advento das novas tecnologias de sequenciamento de DNA viabilizaram a concepção e execução de novos projetos, que se baseiem em abordagens como resequenciamento, sequenciamento de novo, genotipagem por sequenciamento, imputação, metagenômica, etc., mas que demandam armazenamento, tratamento e análise de uma quantidade muito grande de dados. O grande desafio deste projeto, na fase II da Rede Genômica Animal (RGA), é, em parceria com o Laboratório Multiusuário de Bionformática da Embrapa (LMB), ...

Situação: concluído     Data de Início: Tue Jan 01 00:00:00 GMT-03:00 2013

O objetivo deste projeto foi fazer o sequenciamento dos plasmídeos residentes na estirpe S76 de Bacillus thuringiensis, que possui alta capacidade entomopatogênica contra larvas de Diatraea saccharalis. Em razão do baixo custo e da rapidez nas análises, foi usada a técnica de pirosequenciamento de todos os plasmídeos residentes (cerca de dez) na estirpe S76.
O trabalho foi contratado no exterior e a remessa do material seguiu as orientações da Assessoria de Inovação Tecnológ ...

Situação: concluído     Data de Início: Wed Apr 01 00:00:00 GMT-03:00 2009

"O algodoeiro é hospedeiro de um leque de pragas, incluindo-se as ervas daninhas, insetos e patógenos. A estratégia que tem sido adotada para enfrentar tais problemas é a transgenia. Nas cultivares atualmente disponíveis no mercado, os genes inseridos estão regulados sob o comando de um promotor constitutivo, o CaMV 35S, que é de alta expressão na maioria das partes da planta, com exceção das estruturas reprodutivas. Isso limita seu uso para o caso de resistência a insetos que se alimentam de bo ...

Situação: concluído     Data de Início: Tue Apr 01 00:00:00 GMT-03:00 2008

Em várias regiões do país, inclusive no Vale do São Francisco, a presença do nematóide provoca perdas significativas na produção de goiabeiras. Até o momento, não existem métodos de controle efetivos. Produtos químicos, avaliados experimentalmente, não têm sido eficientes no seu controle e não existem nematicidas registrados no Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (MAPA) para utilização nos plantios dessa frutífera. Além disso, a falta de compatibilidade de enxertia de goiabeiras ...

Situação: concluído     Data de Início: Thu Nov 01 00:00:00 GMT-03:00 2012

Considerando a crescente demanda por ferramentas e métodos quantitativos capazes de extrair de dados genômicos informações relevantes para o melhoramento genético e para decisões de manejo em animais domésticos, o presente projeto propôs desenvolver ferramentas e métodos quantitativos para análise de dados genômicos obtidos pela nova geração de tecnologias de sequenciamento e genotipagem em larga escala. A pesquisa gerou um conjunto de conhecimentos, metodologias e ferramentas estatísticas e res ...

Situação: concluído     Data de Início: Tue Jan 01 00:00:00 GMT-03:00 2013

A primeira década do século 21 viu a genômica se consolidar como “sine qua non” para a caracterização de recursos genéticos. Centenas de projetos para decifrar o genoma completo de plantas e microrganismos foram concluídos ou estão em curso. O custo do sequenciamento de DNA tem caído vertiginosamente nos últimos cinco anos e a expectativa é que em 2011 as tecnologias que estarão disponíveis irão permitir sequenciar 100.000 pares de bases por apenas um dólar americano. À medida que o mundo se

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Situação: concluído     Data de Início: Mon Aug 01 00:00:00 GMT-03:00 2011

Em um esforço conjunto reunindo pesquisadores das áreas de biotecnologia, bioinformática, estatística genômica, fisiologia vegetal e melhoramento genético, esse projeto prevê prospectar genes de tolerância à seca. Será abordada a estratégia de mapeamento de associação baseada em GbS e genes-candidatos, com ênfase na proposição de métodos de seleção genômica utilizando marcadores relacionados à QTLs-alvos.

Dados fenotípicos para os componentes de produtividade e morfofisiológicos serão ...

Situação: concluído     Data de Início: Tue Apr 01 00:00:00 GMT-03:00 2014

"Nas últimas décadas registrou-se na Região Sul uma diminuição considerável no rebanho ovino. Ao mesmo tempo, observou-se um aumento no interesse na carne de cordeiro e uma modificação na estrutura dos rebanhos, que passou a ser de menos de 100 ovinos por produtor. Este novo cenário requer um aumento na taxa de cordeiros desmamados anualmente, garantindo maior produtividade na criação de cordeiros e maior renda para o produtor. O aumento da taxa de ovulação (TO) é uma alternativa para incrementa ...

Situação: concluído     Data de Início: Wed Apr 01 00:00:00 GMT-03:00 2009

Os avanços na área de biotecnologia indicam que é possível controlar algumas pragas em diversas culturas de interesse agrícola com um mínimo de impacto no meio ambiente. O Bacillus thuringiensis deposita, no citoplasma da célula em esporulação, inclusões cristalinas de natureza protéica e com atividade para larvas de insetos de diversas ordens. Os genes cry, que codificam as delta-endotoxinas contidas no cristal, podem ser clonados, transferidos e expressos em altos níveis em pla ...

Situação: concluído     Data de Início: Sun Aug 01 00:00:00 GMT-03:00 2010