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MSSP: simultaneous comparison of the same structure descriptor for different protein structures. Autoria: MAZONI, I.; KUSER, P.; YAMAGISHI, M.; BORRO, L.; JARDINE, J.; SANTOS, E. H. dos; OLIVEIRA, S. R. de M.; NESHICH, G. Short Abstract: The Multiple Structures - Single Parameter STING module allows a user to compare variety of structure parameters from different protein structures in a simple yet intuitive 2D pilot. T... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2006
Multiple Structures - Selected Parameter (MSSP) 2D Plot. Autoria: NESHICH, G. The Multiple Structures - Single Parameter 2D module allows a user to compare, in a simple yet intuitive 2D plot, any one of the 150 different sequence, structure, function and stability parameters /... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2010
Contacts as the key elements for comparing two protein structures. Autoria: MELO, R. C.; MAZONI, I.; NESHICH, G.; SANTORO, M. M.; MEIRA JÚNIOR, W. Short Abstract: TopSiMap (Topological Similarity Map) is and interactive tool which is part of the Star Sting Suite (http://sms.cbi.cnptia.embrapa.br/SMS).As contacts pattern is very conserved in each... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2006
Caracterização e análise das estruturas secundárias das zeínas para uso em revestimentos comestíveis. Autoria: DORM, B. C.; SOARES, V. F.; BERNARDES FILHO, R.; OLIVEIRA, J. S.; COLNAGO, L. A.; FORATO, L. A. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2018
The Diamond Sting server. Autoria: NESHICH, G.; BORRO, L. C.; HIGA, R. H.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; FRANCO, E. H.; KRAUCHENCO, J. N.; FILETO, R.; RIBEIRO, A. A.; BEZERRA, G. B. P.; VELLUDO, T. M.; JIMENEZ, T. S.; FURUKAWA, N.; TESHIMA, H.; KITAJIMA, K.; BAVA, A.; SARAI, A.; TOGAWA, R. C.; MANCINI, A. L. Diamond STING is a new version of the STING suite of programs for a comprehensive analysis of a relationship between protein sequence, structure, function and stability. We have added a number of new... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2005
Signature contact coordination patterns for secondary structure elements in protein structures. Autoria: JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; BORRO, L. C.; ALVARENGA, D.; NESHICH, G. We present here analysis of pre-calculated values for the cross-links, previously stored in the STING_RDB. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2008
Structural parameters to filter crucial catalytic site aminoacids from fructose 1,6-bisphosphate aldolase. Autoria: BRANDÃO, M. M.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. Short Abstract: In this work we demonstrate the minimum structural parameters needed to isolate the active site of the fructose 1,6-bisphosphate aldolase, using the Diamond STING suite. DSs is a web b... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2006
Análise de proteínas estruturais e de DNA do baculovirus Condylorrhiza vestigialis nucleopolyhedrovirus. Autoria: CASTRO, M. E. B. de; SANTOS, A. C. B. dos; RIBEIRO, Z. M. de A.; SOUZA, M. L. de; SOUSA, N. J. Estudos vêm sendo desenvolvidos em nosso laboratório sobre a identificação e caracterização de um baculovirus recentemente descoberto, Codylorrhiza vestigialis nucleopolyhedrovirus - CvMNPV (Família B... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2004
Prediction of binding hot spot residues by using structural and evolutionary parameters. Autoria: HIGA, R. H.; TOZZI, C. L. In this work, we present a method for predicting hot spot residues by using a set of structural and evolutionary parameters. Unlike previous studies, we use a set of parameters which do not depend on... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2009
Predicting enzyme class from protein structural parameters and bagging predictors. Autoria: YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. M.; BORRO, L. C.; SANTOS, E. H.; JARDINE, J. G.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; NARCISO, M. G.; KUSER-FALCÃO, P. R.; NESHICH, G. Short Abstract: In this work we present a new method to classify enzymes that uses the STING_DB physical-chemical parameters and Bagging predictors. By building models based on "decision tree" and "ne... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2006

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