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O modelo matemático da estrutura protéica é fundamental não só para a visualização, mas, principalmente, para o cálculo de parâmetros estruturais como área da superfície e volume. É possível usar a ge... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2007

Short Abstract: The Multiple Structures - Single Parameter STING module allows a user to compare variety of structure parameters from different protein structures in a simple yet intuitive 2D pilot. T... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2006

Short Abstract: In this work we present a new method to classify enzymes that uses the STING_DB physical-chemical parameters and Bagging predictors. By building models based on "decision tree" and "ne... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2006

Short Abstract: In this work we demonstrate the minimum structural parameters needed to isolate the active site of the fructose 1,6-bisphosphate aldolase, using the Diamond STING suite. DSs is a web b... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2006

Short Abstract: STING_DB is a relational database composed of structural parameters for protein analysis operating with a collection of both publicly available data (PDB, HSSP, Prosite) and its own da... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2006

The Multiple Structures - Single Parameter 2D module allows a user to compare, in a simple yet intuitive 2D plot, any one of the 150 different sequence, structure, function and stability parameters /... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2010

Short Abstract: TopSiMap (Topological Similarity Map) is and interactive tool which is part of the Star Sting Suite (http://sms.cbi.cnptia.embrapa.br/SMS).As contacts pattern is very conserved in each... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2006

Short Abstract: The AA Co-evolution is a very powerful method of identifying those critical residues which are responsible for maintaining the minimum information for the specific function. By compari... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2006

Os principais desafios relacionados ao problema de classificação de enzimas em banco de dados de estruturas de proteínas são: 1) o ruído presente nos dados; 2) o grande número de variáveis; 3) o númer... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2006

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