Autoria: LEITE, V.; SILVA, R.; YAMAGISHI, M.; CHAHINE, J.

Effect of mutations on the stability of proteins is a crucial issue in protein evolution. Such effects depend strongly on the overall hydrophobic protein character. In a recent work we suggested two s... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2010

Autoria: YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; BORRO, L. C.; OLIVEIRA, S. R. de M.; SANTOS, E. H. dos; JARDINE, J. G.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; NARCISO, M. G.; NESHICH, G.

Short Abstract: In this work we present Java Protein Interface Viewer (JPIV). It is a web-based software designed to visualize and analyse protein-protein interfaces. It uses Delaunay triangulation in... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2006

Autoria: FERRI, N. M. L.; SILVEIRA, C. M. da; CORTELINI, M. de F. M.

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2012

Autoria: NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCÃO, P. R.; NESHICH, G.

Short Abstract: In this work, we present 2DIM (Two Dimensional Interface Maps). It is a graphical interface that permits to visualize the protein-protein interfaces in 2D maps.

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2006

Autoria: MELO, R. C.; RIBEIRO, C.; MURRAY, C. S.; VELOSO, C. J. M.; SILVEIRA, C. H. da; NESHICH, G.; MEIRA JUNIOR, W.; CARCERONI, R. L.; SANTORO, M. M.

We propose a novel method for defining patterns of contacts present in protein-protein complexes. A new use of the traditional contact maps (more frequently used for representation of the intra-chain... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2007

Autoria: PINTO, M. dos S. T.; RIBEIRO, J. M.; OLIVEIRA, E. A. G. de

O estudo do processo pelo qual plantas conseguem sobreviver e se adaptarem às mudanças ambientais é algo que tem importância em diversas áreas do conhecimento científico. Organismos vegetais conseguem... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2011

Autoria: HIGA, R. H.; TOZZI, C. L.

Computational methods for predicting protein-protein interaction sites based on structural data are characterized by an accuracy between 70 and 80%. Some experimental studies indicate that only a frac... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2008

Autoria: STEPHAN, M. P.; FREITAS, S. C. de

Eletroforese de proteínas; Condições de utilização da eletroforese SDS-PAGE; Preparação de amostra de extrato protéico de feijão; Análise de proteínas de feijão em eletroforese SDS-PAGE.

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2005

Autoria: SILVEIRA, C. H. da; PIRES, D. E. V.; MINARDI, R.; RIBEIRO, C.; VELOSO, C. J. M.; LOPES, J. C. D.; MEIRA JÚNIOR, W.; NESHICH, G.; RAMOS, C. H. I.; HABESCH, R.; SANTORO, M. M.

In this study, we carried out a comparative analysis between two classical methodologies to prospect residue contacts in proteins: the traditional cutoff dependent (CD) approach and cutoff free Delaun... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2009

Autoria: MARCONDES, M. I.; PROVAZZI, F. P.; SILVESTRE, T.; SILVA, A. L.; VALADARES FILHO, S. C.; CAMPOS, M. M.; MACHADO, F. S.; ROTTA, P. P.

We aimed to estimate the protein requirements of pregnant Holstein × Gyr cows. Sixty-one Holstein × Gyr (HG) cows were used, with an average initial BW of 480 ± 10.1 kg and 5 ± 0.5 yrs of age. Cows we... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2023