A cotonicultura brasileira ocupa posição de destaque mundial em área plantada, produção, produtividade e exportação de algodão. Com significativos investimentos públicos e privados em pesquisa e tecnologia, e uma cadeia produtiva bastante organizada, foram conquistados os avanços que posicionaram o Brasil entre os principais países produtores e exportadores de algodão. Entretanto, em um cenário de elevada competitividade, são necessários ajustes frequentes e aperfeiçoamentos nos sistemas produtivos por meio da incorporação de práticas e tecnologias que promovam a redução no custo de produção e nos impactos ambientais. A redução no uso de pesticidas para o controle de pragas e doenças é imprescindível, da mesma forma que a manutenção de elevados níveis de produtividade e qualidade do produto. O programa de melhoramento genético do algodoeiro da Embrapa tem se empenhado em gerar tecnologias que contribuam para a superação, bem como para a conquista de novos patamares na produção brasileira, nos sistemas produtivos no Cerrado e no Semiárido do Brasil. O projeto tem por objetivo desenvolver linhagens e cultivares de algodoeiro, convencionais e transgênicas, de elevada produtividade e qualidade de fibra, resistentes às principais doenças e nematoides, que contribuam para a produção sustentável de algodão no Brasil.