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Análise de dados de RNA-Seq utilizando o Galaxy. Author(s): ZERLOTINI NETO, A.; CINTRA, L. C. Neste documento, serão apresentados métodos computacionais para facilitar o processo de análise de dados de RNA-Seq, por meio de ferramentas acessíveis via navegadores. Esta metodologia possibilita o... ... Repository: BDPA Publication year: 2016
RNA-Seq Analysis of Eucalyptus Genotypes that Differ in Carbon Allocation. Author(s): GERHARDT, I. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; LOBO, F. P.; PENCHEL, R. M.; MISSIAGGIA, A. A.; ZERTOLINI, A.; SILVA, F. R. da Repository: BDPA Publication year: 2012
Using Galaxy to facilitate RNA-Seq analysis. Author(s): NAGAI, L. A. E.; SILVA, F. R.; CINTRA, L. C.; GIACHETTO, P. F.; ZERLOTINI NETO, A. In this experiment, two RNA-Seq datasets were analyzed in order to evaluate both, the Galaxy platform and the RNA-Seq analysis suite. We were able to observe that such combination of softwares is real... ... Repository: BDPA Publication year: 2012
RNA-seq analysis of Eucalyptus genotypes that differ in carbon allocation. Author(s): GERHARDT, I. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; LOBO, F. P.; PENCHEL, R. M.; MISSIAGGIA, A. A.; ZERLOTINI, A.; SILVA, F. R. da Repository: BDPA Publication year: 2012
RNA-seq analysis of the Rhizobium tropici CIAT 899 Transcripitome shows similarites in the activation patterns of symbiotic genes in the presence of apigenin and salt. Author(s): PÉREZ-MONTAÑO, F.; CERRO, P. del; JIMÉNEZ-GUERRERO, I.; LÓPEZ-BAENA, F. J.; CUBO, M. T.; HUNGRIA, M.; MEGÍAS, M.; OLLERO, F. J. Rhizobium tropici strain CIAT 899 establishes effective symbioses with several legume species, including Phaseolus vulgaris and Leucaena leucocephala. This bacterium synthesizes a large variety of nod... ... Repository: BDPA Publication year: 2016
Transferibilidade de marcadores microssatélites desenvolvidos a partir de RNA-Seq de amendoim forrageiro. Author(s): OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, A. L. D. da; SILVA, C. C. da; SOUZA, A. P. de; FORMIGHIERI, E. F.; SILVA, L. M. da; CAMPOS, T. de O amendoim forrageiro (Arachis pintoi) apresenta destaque expressivo que traduz a sua importância econômica e ambiental em pastagens. Porém, ainda são poucas as variedades disponíveis para cultivo. O... ... Repository: BDPA Publication year: 2021
Caracterização de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro para o desenvolvimento de novos microssatélites. Author(s): OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, A. L. D. da; SILVA, C. C. da; SOUZA, A. P. de; FORMIGHIERI, E. F.; CAMPOS, T. de O uso do amendoim forrageiro (Arachis pintoi) em pastagens consorciadas com gramíneas tem importância econômica e ambiental. Avanços no programa de melhoramento da espécie podem ser obtidos com a ampl... ... Repository: BDPA Publication year: 2020
Combinação de abordagens de análises de novo e guiadas pelo genoma para explorar dados de RNA-Seq de sementes oleaginosas para anotação de vias de ácidos graxos. Author(s): LEMOS, V. N. S.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; RECH FILHO, E. L.; GRYNBERG, P. Elaeis guineensis (dendê), Jatropha curcas (pinhão-manso) e Ricinus communis (mamona) produzem ácidos graxos que podem ser utilizados como fonte renovável na matriz energética, apresentando um grande... ... Repository: BDPA Publication year: 2021
Transcriptome profiling of twonear-isogenic rice lines infected by Magnaporthe oryzae using RNA-SEQ. Author(s): BEVITORI, R.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M.; GRYNBERG, P.; GUIMARÃES, L. S. M.; ABREU, A. G. de; MELLO, R.; GROSSI DE SÁ, M. F. The research described here focused on early signaling events involved in the expression of rice genes in plants infected with M. oryzae using RNA-Seq technique for differential gene expression we ana... ... Repository: BDPA Publication year: 2015
Molecular, behavioral and anatomical sophistication in spider webs: insights from spinning gland RNA-seq experiments in primitive and modern spiders. Author(s): PROSDOCIMI, F.; BITTENCOURT, D.; SILVA, F. R. D.; MOTTA, P. C.; RECH, E. RNA-seq experiments conducted in 454 sequencers were carried out to produce 87.000 short-reads representing the transcriptome of two spiders?spinning glands. We produced sequences from (i) Actinopus s... ... Repository: BDPA Publication year: 2010

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