Os begomovírus são geminivírus transmitidos por mosca-branca e causam danos devastadores em todo o mundo, principalmente em plantas de mandioca, algodão, tomate, pimentão e feijão. No Brasil, este grupo de vírus é especialmente importante em tomateiro e feijoeiro. As doenças causadas por begomovírus se tornaram mais sérias após a introdução do biótipo B da mosca-branca, que hoje representa uma das pragas mais sérias da agricultura. A equipe de pesquisadores da Embrapa vem estudando os begomovírus desde a década de 90. Além da infraestrutura adequada para os estudos, a equipe acumulou experiência e conhecimento em vários aspectos da identificação, detecção e caracterização desses vírus. Face ao potencial destrutivo dos begomovírus em culturas de grande impacto na agricultura brasileira, este projeto vislumbra realizar um levantamento dos possíveis begomovírus que estão presentes nessas culturas para contribuir na tomada de decisões estratégicas para o controle das doenças. O trabalho envolve visitas a campos de produção, realização de testes de detecção, clonagem e sequenciamento dos begomovírus, análise das sequências quanto à identificação em nível específico e realização de estudo de diversidade e de evolução viral.